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  《辽宁师范大学学报(自然科学版)》为季刊,主要刊载数学、物理学、化学、生 ...

卡那霉素A与腺嘌呤间氢键作用位点的研究

作者:黄翠英 姜笑楠 王萌

关键词: 卡那霉素A; 腺嘌呤; 氢键作用; 作用位点; 相互作用能;

摘要:采用B3LYP/6-31+G(d,p)方法优化得到了卡那霉素A的简化模型与腺嘌呤形成的9个氢键复合物的稳定结构,并在M06-2X-D3/aug-cc-pVDZ水平下分析该类复合物分子在气相、蛋白相和水相中的相互作用能.研究结果表明,卡那霉素A使用3号位点与碱基形成的氢键复合物更稳定;腺嘌呤则倾向使用3号位点与卡那霉素A形成氢键复合物.同时研究了卡那霉素A各位点的质子化和去质子化反应焓变,发现这些结果可作为卡那霉素A不同位点氢键复合物相对稳定性的推断依据.


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